基于TCGA数据库信息分析肝细胞癌组织miR-3607-3p表达及其临床意义
目的 既往研究发现,miR-3607-3p在乳腺癌和前列腺癌等肿瘤中异常低表达且涉及肿瘤的发生与发展,但miR-3607-3p在原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达及意义尚不清楚.本研究利用癌症基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库信息分析HCC组织中miR-3607-3p的表达情况及其临床意义,并对miR-3607-3p靶基因进行有关的生物信息学综合分析.方法 基于TCGA数据库,比较HCC组织和癌旁组织中miR-3607-3p表达量,并分析rniR-3607-3p表达量与HCC患者临床病理特征及预后的相关性.采用生物信息学方法对miR-3607-3p的靶基因进行预测及功能富集分析,并结合蛋白互作网络及预后分析结果筛选miR-3607-3p关键靶基因.结果 HCC组织miR-3607-3p表达量较癌旁组织下调,差异有统计学意义,t=9.910,P＜0.001;且miR-3607-3p表达量对于HCC组织具有良好的诊断效能,AUC=0.853,P＜0.001.HCC组织miR-3607-3p表达量与患者TNM分期(t=2.366,P=0.019)和血清甲胎蛋白(t=3.275,P=0.001)等指标相关.生存分析表明,HCC组织中低表达miR-3607-3p是影响HCC患者总生存率[HR=2.171(95％ CI:1.435～3.286),P＜0.001]和无复发生存率[HR=1.566(95％CI:1.050～2.335),P=0.028]的独立预后因素.富集分析提示,miR-3607-3p靶基因主要富集于上皮间质转化、细胞分化、细胞周期及增殖调控等生物学功能,以及Ras信号通路等通路,均P＜0.05.此外,ANLN、CENPF、HMMR和KIF15等为本研究所筛选出的miR-3607-3p关键靶基因,其在HCC组织中均呈现表达上调(均P＜0.001),且与miR-3607-3p表达量呈负相关(ANLN:r=-0.272,P＜0.001;CENPF:r=-0.273,P＜0.001;HMMR:r=-0.104,P=0.048;KIF15:r=-0.252,P＜0.001).预后分析提示,HCC组织中ANLN、CENPF、HMMR和KIF15相对高表达者均与不良总生存率(ANLN:x2 =19.92,P＜0.001;CENPF:x2 =23.13,P＜0.001;HMMR:x2 =27.22,P＜0.001;KIF15:x2 =24.24,P＜0.001)和无复发生存率(ANLN:x2=29.14,P＜0.001;CENPF:x2=19.21,P＜0.001;HMMR:x2=18.82,P＜0.001;KIF15:x2=16.24,P＜0.001)存在统计学意义的关联.结论 miR-3607-3p可作为一种抑癌基因参与HCC发生、发展,并具有成为HCC诊断标志物、预后指标及治疗靶点的潜在应用价值.
肝细胞癌、miR-3607-3p、预后、TCGA数据库
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R735.7(肿瘤学)
2019-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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