甲状腺乳头状癌miRNA差异表达谱分析
目的 甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)发病率逐年上升,快速准确的早期诊断非常重要.本研究通过PTC与健康对照的高通量miRNA测序,提供全面的miRNA差异表达谱,寻找可能的肿瘤标志物,从整体层面阐明PTC转录后调控作用.方法 选取2017-08-01-2017-12-31南京市第一医院收治的病理确诊PTC患者30例,健康对照10名,提取外周血RNA进行高通量miRNA测序.将过滤后的目标序列分类注释,根据样本间表达量信息采用泊松分布(ExpDiff)筛选差异表达miRNA,随后进行靶基因预测、层次聚类分析、基因本体(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书通路(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes pathway,KEGG pathway)显著性富集分析.结果 本次高通量测序共预测得到579 831个miRNA.共筛选到12个有望成为PTC肿瘤标志物的miRNA,其中10个miRNA在PTC患者较对照组高表达,分别为miR-3184-3p、miR-103b、miR-142-5p、miR-374a-5p、miR-142-3p、miR-144-3p、miR-32-5p、miR-106a-5p、miR-126-5p和miR-101-3p,P≤0.01;2个miRNA在PTC患者较对照组低表达,分别为miR-378b和miR-103a-3p,P≤0.01.细胞和信号转导是最显著富集的GO词条(term)和KEGG pathway.结论 本次高通量测序提供了全面的miRNA差异表达谱,并筛选到12个有望成为PTC肿瘤标志物的miRNA,具有重要理论意义以及潜在应用价值.
甲状腺乳头状癌、miRNA、高通量测序、肿瘤标志物
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Q736.1(生物膜的结构和功能)
南京医科大学科技发展基金重点项目2016NJMUZD044;泰州市科技支撑社会发展项目SSF20170218
2019-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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