基于生物信息学数据库分析卵巢癌组织UBE2C表达及意义
目的 泛素结合酶E2C(ubiquitin-conjugating enzyme E2C,UBE2C)在多种癌症中过表达且与患者的不良预后相关,但关于UBE2C在卵巢癌中的具体作用及潜在功能尚不清楚.本研究探讨UBE2C在卵巢癌组织中的表达、临床意义及潜在功能.方法 Oncomine及人类蛋白质图谱(the human protein atlas,HPA)在线数据库分析UBE2C在正常卵巢组织及卵巢癌组织中的表达差异.选取中国医科大学附属盛京医院2016-12-01-2017-05-01手术治疗的72例卵巢组织标本,其中卵巢癌组织45例,正常卵巢组织26例,采用RT-qPCR法检测UBE2C表达水平.从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库下载卵巢癌组织中关于UBE2C的RNAseq数据及临床数据,分析UBE2C表达与卵巢癌临床病理参数及预后的关系.基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)探讨UBE2C在卵巢癌中的潜在功能.结果 Oncomine及HPA数据库分析结果均提示与正常卵巢组织相比,UBE2C在卵巢癌组织中高表达.RT-qPCR验证结果显示,UBE2C在正常卵巢组织及卵巢癌组织中表达水平分别为1.023±0.102、3.457±0.541,差异有统计学意义,t=2.684,P=0.0091.TCGA数据分析结果显示,过表达的UBE2C与卵巢癌患者的不良组织学分级相关,χ2=5.684,P=0.017.Cox回归分析结果表明,UBE2C可能是卵巢癌患者不良预后的独立风险因素,HR=1.324,95％CI:1.003～1.749,P=0.04.GSEA分析结果表明,UBE2C在细胞周期调控及同源同组修复通路相关基因集中高度富集.结论 UBE2C在卵巢癌的发生发展进程中发挥重要作用,可为将来UBE2C抑制剂在卵巢癌治疗的临床前研究提供理论依据.
卵巢癌、UBE2C、生物信息学数据库、临床意义、细胞周期
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R737.71(肿瘤学)
沈阳市科技计划17-230-9-10;辽宁省卵巢癌恶性肿瘤病例信息平台的建立及诊治技术规范化推广项目LNCCC-A01-2015;中国医科大学2017年度学科提升计划2017CXTD05;盛京自由研究者计划201704
2019-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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