高通量数据分析CXCL8在宫颈癌中组织表达与预后关联分析
目的 CXCL8在多种肿瘤中异常表达,参与肿瘤的发生发展,但在宫颈癌中的表达及预后情况鲜见有报道.本研究旨在探讨CXCL8在宫颈癌组织中的表达情况及其与肿瘤患者预后的相关性.方法 利用GEPIA在线数据库(包括TCGA和GTEx RNA测序表达数据)和从GEO数据库中下载的三套基因表达谱芯片数据,分别分析CXCL8基因在宫颈癌组织及正常对照组织中的表达情况.运用GEPIA数据库分析CXCL8表达对宫颈癌患者预后的影响.使用表达谱数据对CXCL8基因进行ROC曲线分析,评价该基因的诊断价值.结果 GEPIA数据库在线分析结果显示,宫颈癌组织中CXCL8基因高表达,在正常对照组织中低表达,差异有统计学意义,log2(Fold Change)=3.827,P<0.001.在GSE7803、GSE9750和GSE63514三套表达谱芯片数据中,CXCL8基因在肿瘤组织中均显著上调表达(t值分别为4.486、8.294和4.593,均P值<0.001).通过GEPIA在线分析,CXCL8高表达患者总生存期短于低表达患者(HR=2.9,P<0.001).受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)分析提示CXCL8基因具有较高的诊断价值.结论 通过对高通量数据挖掘发现,CXCL8在宫颈癌组织中mRNA水平表达上调,且高表达与患者生存期缩短有关联,可以作为宫颈癌预后的生物标志物进一步研究.
宫颈癌、CXCL8、高通量数据、表达、预后
25
R737.33(肿瘤学)
国家自然科学基金81360336;云南省科技厅-昆明医科大学联合专项基金2015FB017;昆明医科大学百名中青年学术技术骨干项目60117190449
2019-01-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共5页
1495-1499