基于二代测序的口咽癌HPV-16病毒整合位点检测新方法的建立与应用

摘要：

目的:构建一个基于二代测序的口咽癌HPV-16病毒整合位点检测新方法,明确建库条件和流程,评估测序结果和质量,为口咽癌临床诊疗提供技术手段和理论支持.方法:对HPV-16阳性的口咽癌细胞UM-SCC-47以及5对临床标本利用多重PCR方法进行DNA建库和测序,评估测序深度及偏倚性,对测序数据进行分析,找出HPV-16整合位点所在基因.结果:成功构建了测序体系,可在96孔板中批量实现并于12小时内完成.石蜡包埋组织与新鲜组织测序质量并无差异.分析得到HPV-16整合位点所在的19个基因.结论:一个基于二代测序的口咽癌HPV-16整合位点检测新方法已成功构建.该方法建库时间短,成本低,测序深度有保证,方便应用和推广.

关键词：HPV、口咽癌、二代测序、整合位点

所属期刊栏目：33

分类号：R722;Q78;R394

资助基金：国家自然科学基金;山东省自然科学基金;山东省医药卫生发展计划

在线出版日期：2022-07-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1-5