月季密码子使用模式及其偏好性分析

摘要：

为了分析月季密码子使用偏好性及其成因,对月季1794个注释基因的密码子进行研究,结果表明:月季密码子的平均CAI含量为19％,平均GC3s含量为27.2％,平均ENC含量为52.8％,基因密码子第3位偏好使用A、T碱基,密码子的使用偏好性较弱.ENC-plot和PR2-plot分析表明月季密码子偏好性除了受中性突变影响外,还可能受如选择压力等因素影响.RSCU值分析显示月季37个高表达优越密码子中以A/U结尾的有24个,结合26个高频密码子最终确定18个最优密码子,其中15个以A/U结尾.该结果揭示了月季密码子的使用偏好性,为研究月季密码子的使用模式及月季经济性状的遗传改良提供参考.

关键词：月季、密码子、偏好性

分类号：S685.12(观赏园艺（花卉和观赏树木）)

资助基金：中央财政林业科技推广示范项目

在线出版日期：2023-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：45-51