还原当量对克雷伯氏杆菌代谢路径冗余性的影响

摘要：

以克雷伯氏杆菌基因组尺度代谢网络模型iYL1228为研究对象,应用基于热力学约束的通量可变性分析对代谢路径进行冗余性分析.首先对iYL1228添加热力学约束应用通量平衡分析,确定底物甘油单位生产率达到最大时的最优路径以及依赖还原当量NADH的可调控反应;然后应用添加热力学约束的通量可变性分析研究了最优路径中依赖NADH的可调控反应对路径冗余性的影响.结果表明:在最优路径中,依赖还原当量的可替代反应乙醛脱氢酶ACALD、谷氨酸脱氢酶GLUDx和转氢酶NADTRHD对路径冗余性影响较大,其反应通量越大,路径冗余性越差;而依赖还原当量的必需反应甘油脱氢酶GLYCDx和苹果酸脱氢酶MDH对路径冗余性影响较小,可用于后期的辅因子特异性优化分析.

关键词：克雷伯氏杆菌、路径冗余性分析、热力学约束、还原当量、通量可变性分析

所属期刊栏目：38

分类号：Q93.3(微生物学)

资助基金：山东省自然科学基金项目ZR2013BM001

在线出版日期：2018-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：18-23