基于支持向量机的人类ncRNA基因预测

摘要：

提出一种新的基于支持向量机的人类ncRNA基因预测方法.首先从GENCODE数据库和UCSC数据库中提取人的ncRNA和mRNA序列数据,选择单核苷酸、二核苷酸出现频率等86个特征作为原始数据,其次利用离散小波变换去除冗余信息和噪声,最后建立离散小波变换与支持向量机相结合的ncRNA基因预测模型(DWT-SVM).实验结果表明DWT-SVM模型对测试集ncRNA的预测准确率为93.71%,优于PCA-SVM和DWT-KNN两种预测模型的预测结果.

关键词：非编码RNA、基因预测、支持向量机、离散小波变换

所属期刊栏目：38

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金项目51372125;山东省自然科学基金项目ZR2013AM007, ZR2014FL021;山东省高等学校科技计划项目J13LI54;青岛科技大学大学生创新训练计划项目201606002

在线出版日期：2017-05-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：112-118