基于小波分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段预测

摘要：

基因组计划所产生的大量蛋白质序列迫切需要从理论上预测跨膜螺旋区段.提出了基于小波多分辨分析的BP神经网络膜蛋白跨膜螺旋区段的预测新方法,并把此方法称之为WnnTM.从MPtopo数据库中随机抽取80条三维结构已知的膜蛋白质序列构建数据集,把它们映射成疏水值序列,通过小波分解和重构得到小波系数,并结合BP神经网络构造小波BP神经网络预测模型,对膜蛋白跨膜螺旋区段的位置和数目进行预测.实例验证,WnnTM预测方法比单独用BP神经网络对膜蛋白跨膜螺旋区段进行预测更有效.

关键词：小波分析、BP神经网络、膜蛋白、跨膜螺旋区段

所属期刊栏目：31

分类号：O174.22;Q811.4(数学分析)

资助基金：国家自然科学基金项目30871341;科技部重大科技专项基金项目2008ZX10002-017

在线出版日期：2011-04-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：583-587,597