基于小波变换的膜蛋白跨膜螺旋区段预测分析

摘要：

提出了一种基于离散小波变换的预测膜蛋白跨膜螺旋区段数目和位置的方法.以PDB代码为1F88的膜蛋白为例,描述了该方法对跨膜螺旋区段的数目和位置的预测分析过程.为了测试方法的实际效果,采用19条膜蛋白序列作为测试集,并将预测结果与DAS、PRED-TMR2、SOSUI、HMMTOP2.0、TMHMM2.0五种常用预测方法的主要预测结果进行比较.结果表明,本工作提出的方法具有较高的预测准确度.

关键词：小波变换、膜蛋白、跨膜螺旋区段

所属期刊栏目：29

分类号：O174(数学分析)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2006AA022190;山东省教育厅资助项目J06P04

在线出版日期：2008-06-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：118-122