芝麻Cu/Zn超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析
铜/锌超氧化物岐化酶(Cu/Zn-SOD)是植物体内非常重要的一种活性氧清除酶系统,本研究通过blast的方法,在芝麻全因组水平进行 Cu/Zn-SOD 的鉴定.结果显示,芝麻中含有 4 条 Cu/Zn-SOD,分别命名为SiCSD1、SiCSD2、SiCSD3、SiCSD4.理化性质分析表明,4 种蛋白质均为酸性蛋白质,除SiCSD3 外,均为亲水蛋白.结构域分析发现,蛋白质均含有Cu/Zn-SOD特有的结构域和金属离子结合域,但都不具有跨膜结构和信号肽.亚细胞定位预测分析发现,SiCSD1-3 均定位于叶绿体,SiCSD4 除了叶绿体,也有可能定位于细胞质.进化树分析发现,SiCSD3 与拟南芥AtCSD2 聚为一支,SiCSD4 与拟南芥AtCSD3 聚为一支,SiCSD1 和SiCSD2 与烟草NpSODC、番茄SlSODC1 和SlSODC2 聚在一个大的分支.以上结果初步表明,SiCSD1-4 具有Cu/Zn-SOD共同的理化性质,其序列的鉴定将为后续功能的研究打下基础.
芝麻、Cu/Zn超氧化物歧化酶、SOD、全基因组、分析
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S-3(农业科学研究、试验)
衡水学院校级课题项目;河北省果蔬发酵技术创新中心专项课题项目;衡水学院高层次人才科研启动基金项目;衡水学院校级科研项目
2023-11-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共4页
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