贵州老鹰茶基于叶绿体DNA的遗传多样性分析
利用H-psbA与L-F 2个叶绿体DNA片段对来自贵州省遵义市湄潭县的老鹰茶古树种质资源进行遗传多样性分析.结果表明,与GenBank中的Actinodaphne lancifolia(登录号为NC_045251.1)相似值达100%,通过构建系统发育树发现该方法可以有效区分白芽株、红芽株、黄芽株,但不能有效区分雌雄性别.2个叶绿体DNA片段经测序、拼接、比对和合并之后片段长度为976 bp,共有41个多态性变异位点,其中包含28个单一突变位点、5个插入-缺失位点、11个简约信息位点.H-psbA与L-F区域的多态性变异位点数量分别为39个和2个,单倍型数分别为9个和2个,合并之后的叶绿体DNA片段的单倍型数为10个.核苷酸多样性与单倍型多样性较高区域为trnH-psbA(Pi=0.01892,Hd=0.978),较低区域为trnL-trnF(Pi=0.00212,Hd=0.467),10份老鹰茶植物植物2个叶绿体DNA区域合并后的遗传多样性较高(Pi=0.01126,Hd=1.000).Tajima's测验中,2个叶绿体DNA区域在各检验水平上均不显著,说明这2个叶绿体DNA区域在进化上遵循中性模型.
老鹰茶、叶绿体DNA、贵州、遗传多样性
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S646.9
贵州科学院青年院基金项目
2022-08-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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