鸡CEBPA和Six1基因的多态性及其与屠体和体尺性状的相关分析

摘要：

CCAAT/增强子结合蛋白α基因(CCAAT/enhancer binding protein alpha gene,CEBPA)在脂肪生成、生长发育过程中发挥重要作用,同源异型基因Six1(sine oculis homeobox homolog 1 gene)在骨骼肌的发育和肌纤维类型的转化中起调控作用,且两者均与骨骼的发育密切相关.本研究以CEBPA和Six1基因为候选基因,采用直接测序法检测2个基因外显子的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),并分析其对无量山乌骨鸡(Gallus gallus)屠体和体尺性状的影响.研究结果表明,在CEBPA基因外显子上共检测到74C＞G、552 G＞A、936 C＞T 3个突变位点,在Six1基因外显子上共检测到375 G＞A和564G＞A2个突变位点,其中只有CEBPA基因74 C＞G位点的突变引起了氨基酸的变化,且为中性突变.连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析发现,CEBPA基因的各突变位点间、Six1基因的各突变位点间均不存在强连锁不平衡.在无量山乌骨鸡群体中,CEBPA基因的3个SNPs位点形成了5种单倍型和7种双倍型,Six1基因的2个SNPs位点形成了4种单倍型和5种双倍型.关联分析表明,CEBPA基因的74 C＞G突变位点对半净膛率、全净膛率、体斜长、胸宽、胸深和龙骨长有显著或极显著影响(P＜0.05或P＜0.01),936 C＞T突变位点对活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、体斜长、骨盆宽和胫长有显著或极显著影响(P＜ 0.05或P＜0.01).双倍型H1H1、H4H4的半净膛率、全净膛率,H1H2的胸肌重、骨盆宽、胫长,H1H4和H4H4的体斜长,H4H4的胸宽、胸深、龙骨长分别显著高于其他部分双倍型(P＜0.05或P＜0.01);Six1基因的375 G＞A和564 G＞A突变位点对部分屠体和体尺性状有显著性影响(P＜ 0.05或P＜0.01),双倍型H6H6、H6H7、H6H8的胸肌重、胸肌率,H6H7的屠宰率,H6H8的全净膛重、胸深、骨盆宽,H7H7的胸角、胫长、胫围,分别显著高于其他部分双倍型(P＜0.05或P＜0.01).本研究结果表明,CEBPA基因和Six1基因的多态性对无量山乌骨鸡的屠体和体尺性状有显著影响,可作为无量山乌骨鸡及其他鸡种屠体和体尺性状分子标记辅助性选择的候选基因.

关键词：CCAAT/增强子结合蛋白α基因(CEBPA)、同源异型基因Six1、单核苷酸多态性、屠体和体尺性状、鸡

所属期刊栏目：26

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金2016XZZX005-04;浙江省农业畜禽新品种选育重大科技专项2016C02054-15

在线出版日期：2018-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：457-468