三种数字PCR平台对多靶标质粒标准物质的定值

摘要：

数字PCR是一种不依赖于外部标准曲线而对目标DNA/RNA进行绝对定量的测量技术,在转基因生物的定量检测、外源基因拷贝数分析以及标准物质定值方面具有广阔的应用前景.本研究基于3种数字PCR平台:微流控芯片数字PCR(chamber digital PCR,cdPCR)、QX1 00 TM微滴数字PCR(droplet digital PCR,ddPCR)和QuantStudioTM 3D数字PCR(3D digital PCR,3D-dPCR),分别测定转基因油菜(Brassica campestris)多靶标质粒DNA标准分子pCAN的外源品系特异性序列拷贝数和内源标准基因磷酸烯醇丙酮酸羧化酶基因(phosphoenolpyruvate carboxylase,PEP)拷贝数,二者之比即为pCAN标准分子的特性量值.实验结果表明,三种数字PCR平台对多靶标质粒分子的各靶标的量值测定结果均接近真实值1(copies/copies),且反应体系稳定,重复性良好,相对标准差(relative standard deviation,RSD)均小于25％,说明这三种数字PCR技术均能准确地对质粒标准物质进行定值.同时,本研究建立的基于cdPCR、ddPCR和3D-dPCR平台的质粒标准物质的定值方法也为其他形式标准物质的定值提供新的方法借鉴.

关键词：转基因生物、多靶标质粒标准物质、微流控芯片数字PCR、QX100TM微滴式数字PCR、QuantStudioTM 3D数字PCR

所属期刊栏目：25

分类号：S-3(农业科学研究、试验)

资助基金：国家转基因生物新品种培育科技重大专项2016ZX08012-003

在线出版日期：2017-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1500-1507