六种甘蓝自交不亲和雄性决定因子部分cDNA的克隆及序列分析

摘要：

S-富含半胱氨酸蛋白(SCR)是自交不亲和雄性决定因子,为了比较甘蓝不同S单倍型SCR基因结构和蛋白分子特性,依据mRNA的ployA序列和SCR保守氨基酸序列设计引物,利用巢式PCR技术分别获得了6种甘蓝(Brassica oleracea L.)D3、E1、240、A1、N1和G1的SCR基因的部分cDNA序列,均包含3UTR.生物信息学分析表明,6条cDNA序列长度分别为319、311、290、288、385和377bp,分别编码1个58、58、58、58、58和55个氨基酸的SCR蛋白,其中D3的SCR与SCR3序列一致,甘蓝E1、240、Al和N1的SCR与SCR7序列一致,而甘蓝G1的SCR为一个新的S单倍型基因.研究表明,不同S单倍型的SCR二级结构和三维结构都有差异,其与S-位点受体激酶(SRK)相互作用的氨基酸在SCR分子表面,富含碱性氨基酸,且SRK-SCR相互作用需要静电荷参与.同时研究还表明,甘蓝自交不亲和性强度多样性,除了SCR和SRK本身作用能力因素以外,还与SCR和SRK分子的数量有关,而SCR的数量是通过3UTR在mRNA水平调控的.分析表明,SCR的进化速度很快,并且3'UTR的进化速度高于氨基酸编码区的进化速度.本研究为进一步探索和利用自交不亲和机制提供了理论基础.

关键词：甘蓝、自交不亲和、雄性决定因子、cDNA克隆、序列分析

所属期刊栏目：20

分类号：R74;R49

资助基金：国家自然科学基金项目30971849;重庆市自然基金重点项目cstc2012jjB80010

在线出版日期：2012-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：616-626