甘蔗叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析

摘要：

以甘蔗(Saechamm Complex)3个生长时期的功能叶片为材料,利用Oligo-capping法构建了一个甘蔗叶片全长cDNA文库.经鉴定该文库库容为3.0×106cfu,重组率为89%,全长率为85%,平均插入片段约为1 kb.利用该文库获得了228条5'端有效表达序列标签(EST).生物信息学分析表明,EST序列拼接出154个假定独立转录本(tentative unique transeript, TUT);NCBI同源比对分析表明,其中117条EST拼接的87个TUTs与已知功能基因具有较高的同源性,这些EST涉及细胞生长、信号转导、蛋白质合成、转录、抗逆反应、能量代谢等功能.

关键词：甘蔗叶片、cDNA文库、表达序列标签(EST)

所属期刊栏目：17

分类号：S188(农业生物学)

资助基金：国家高技术研究发展863项目2007AA100701;农业部引进国际先进农业科学技术948项目2006-G37;福建省科技厅国家科技项目备案F2007AA100701;现代农业产业技术体系建设专项资金nycytx-024

在线出版日期：2009-12-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：843-850