作物生长模型分布式并行调度方案的比较

摘要：

为了提高作物生长模型的计算速度,论文提出了多种分布式并行调度方案.综合分析了田块尺度下作物生长子模型以及子模型内部组分的数据依赖关系和计算流程.以流水线技术和分治策略为基础,分别在模型组分层、子模型层和驱动数据层设计了不同的分布式并行调度方案.在WCCS2003(Windows Compute Cluster Server 2003)组成的PC集群环境下,分别采用了OpenMP、MPI OpenMP混合以及MPI编程模型实现了多种调度方案的并行模拟.并行加速比的实验分析表明,优化后的子模型层并行调度方案,在6个双核CPUs组成的PC集群上的平均加速比可达到8.2,更接近模型并行计算加速比的预测值.在分布式集群环境下,采用基于MPI的子模型层中等粒度的并行调度方案具有更快的计算速度,更适合于作物生长模拟系统.

关键词：作物、并行算法、消息传递、生长模拟模型、集群、共享内存

所属期刊栏目：27

分类号：S126;TP391(农业物理学)

资助基金：国家自然科学基金资助30971697；江苏省科技支撑计划资助BE2009342；国家大学生创新计划GJ0835

在线出版日期：2012-07-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：237-243