基于多组学数据分析PUF家族基因在肝癌中的表达及其临床意义

摘要：

目的 探讨PUF家族基因(PUM1、PUM2、PUM3)作为肝癌的潜在预后标志物及其可能的分子调控机制.方法 TCGA数据库分析PUM1、PUM2、PUM3在正常肝组织、癌旁组织和肝癌组织中的表达及差异;Kaplan-Meier曲线分析PUM1、PUM2、PUM3表达与肿瘤患者预后;cBioPortal数据库分析PUM1、PUM2、PUM3在肝癌中的突变情况;String网站及Cytoscape软件构建PUM1、PUM2、PUM3共表达基因的蛋白互作网络;GO/KEGG对PUM1、PUM2、PUM3共表达基因进行功能富集分析;TIMER 2.0 数据库分析PUM1、PUM2、PUM3与肿瘤免疫细胞浸润的相关性.结果 PUM1、PUM2、PUM3 在肝癌组织的表达高于癌旁组织及正常肝组织(P均＜0.001);PUM1、PUM2、PUM3 阳性蛋白表达主要集中于细胞核或细胞质;PUM1 表达与患者年龄、BMI及组织学分级相关(P均＜0.05);PUM2 表达与患者性别、年龄及病理分期相关(P均＜0.05);PUM3 表达与肿瘤T分期及病理分期相关(P均＜0.05);PUM1、PUM2、PUM3 高表达的肝癌患者预后差(P＜0.05);PUMs共表达基因主要富集于RNA剪切、P53 类介质对信号转导的正向调节作用、剪接体组装、转录因子复合体、钙粘蛋白(E-cadherin)结合、P53 结合位点及细胞周期等通路.同时PUM1、PUM2、PUM3表达与辅助性T细胞、中枢记忆性T细胞、辅助性T细胞 2 及嗜酸性粒细胞浸润水平呈正相关关系.结论 PUM1、PUM2、PUM3 在肝癌发生发展过程中发挥重要作用,可作为潜在的分子治疗靶点和预后评价标志物.

关键词：肝细胞癌、PUF家族基因、预后、免疫浸润、生物信息学

所属期刊栏目：45

分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金81960533

在线出版日期：2023-10-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：668-675