宁夏一株人呼吸道合胞病毒B亚型全基因组基因特征分析

摘要：

目的 了解2020年宁夏地区人群常见呼吸道病毒感染分布情况,对一株人呼吸道合胞病毒(human respiratory syncytial virus,HRSV)宁夏株进行全基因组测序,对其进行基因型别鉴定及基因进化分析.方法 选取2020年宁夏新冠肺炎疫情期间具有呼吸道感染症状的480人作为研究对象,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(real time reverse transcription polymerase chain reaction,real time RT-PCR)方法对甲型流感病毒(FluA)、乙型流感病毒(FluB)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(PIV)Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、呼吸道腺病毒(RAdV)、人偏肺病毒(HMPV)等8种呼吸道病原进行检测.对筛选出的HRSV进行全基因组测序,测序结果经分子生物学软件拼接,与GenBank中相关代表株序列进行分子进化分析.结果 检出呼吸道病毒51例,阳性率为10.6%,RSV检出率最高(4.0%)(19/480).宁夏首株China/ningxia/2020-02的全基因组序列为15259 bp核苷酸,与RSV-A亚型原型株Long株的核苷酸同源性最低为80.9%,与RSV-B亚型原型株9320株的核苷酸同源性为96.0%,提示了宁夏首株HRSV为B亚型.G基因遗传进化树表明,该毒株与BA9基因型代表株聚集在同一分支上,划分为BA9基因型.结论 新型冠状病毒肺炎流行期间,应加强呼吸道病毒的监测,对人呼吸道合胞病毒的全基因组测序研究,有必要连续监测本地区RSV亚型流行趋势,为预防和控制RSV感染提供指导,为筛选疫苗株提供参考.

关键词：呼吸道病毒、人呼吸道合胞病毒、B亚型、基因组序列分析

所属期刊栏目：44

分类号：R373.1(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：宁夏重点研发项目;宁夏自治区青年拔尖人才培养工程项目

在线出版日期：2022-11-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：886-891,912