基于GEO数据库筛选动脉粥样硬化发生的关键差异circRNA
目的:环状RNA(circRNAs)是一种内源性非编码RNA,与生长发育过程以及神经系统退行性病变、肿瘤以及动脉粥样硬化(AS)等疾病密切相关.然而,circRNAs在AS中的作用尚不清楚.本研究可能为诊断和治疗AS提供候选靶点及理论依据.方法:1)我们通过基因表达综合数据库(GEO)分析DECs在外泌体中的表达水平.2)我们通过CSCD在线数据库分析筛选出的hsa_circ_0003645功能,并对靶基因进行预测分析和富集分析.3)通过构建PPI网络筛选出关键基因并进行GO和KEGG富集分析.4)通过Enrichr数据库的DrugMatrix分析与关键基因相互作用的小分子药物.结果:1)我们通过GEO数据库分析DECs在外泌体中的表达水平,选择hsa_circ_0003645进行后续研究.2)我们通过CSCD在线数据库鉴定出hsa_circ_0003645具有较高的蛋白质编码能力,含有eIF4AIII和TDP-43两个结合位点,可能与56个miRNA发生相互作用,并对靶基因进行预测分析和富集分析.3)通过构建PPI网络筛选出排名前20的关键基因并进行GO和KEGG富集分析,结果发现hsa_circ_0003645的20个关键基因的主要富集在protein ubiquitination、regulation of cell motility、cell periphery、FoxO signaling pathway、Focal adhe-sion、Wnt signaling pathway.4)通过Enrichr数据库的DrugMatrix分析与20种关键基因相互作用的小分子药物,这些结果说明这些小分子药物可能具有治疗AS的潜在能力.结论:本研究所鉴定的hsa_circ_0003645、eIF4AIII和关键基因有助于我们了解AS的发病机制和进展,也可能有助于为AS的诊断和治疗提供候选靶点.
动脉粥样硬化、circRNA、hsa_circ_0003645
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R534.5(寄生虫病)
内蒙古自治区高等学校科学研究项目;内蒙古自治区自然科学基金项目;内蒙古医科大学附属医院博士启动金项目
2021-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
132-139
