基于生物信息学对老年耳聋靶基因的筛选

摘要：

目的:利用生物信息学分析与老年耳聋相关的关键基因.方法:GSE49522基因芯片来自公共基因芯片数据平台(GEO),样本来源包括听力良好的年轻成年小鼠8只、重度老年耳聋小鼠5只.采用R语言筛选差异表达基因,利用DAVID数据库和Metascape对差异表达基因进行富集分析,进一步应用String数据库构建蛋白质相互作用网络,最后利用Cytoscape插件CytoHubba筛选关键基因.结果:听力良好的年轻组和老年耳聋组共筛选出173个差异基因,GO分析显示差异基因生物学功能主要涉及超氧阴离子生成的调控、免疫系统过程的负性调节、活性氧代谢过程的正向调控、淋巴细胞增殖、单个核细胞增殖、白细胞增生等;Metascape通路富集结果显示差异基因主要与氧化应激与氧化还原途径、IL-17信号通路、TGF-β信号通路相关.结论:根据生物信息学分析,筛选出10个基因Tyrobp、Fcgr3、Itgb2、Mpeg1、C1qb、C1qc、Ly86、Lyz2、Lyz1、Emr1,可能是老年耳聋的发生发展过程中的关键基因.

关键词：老年耳聋、生物信息学、基因表达

所属期刊栏目：45

分类号：R764.436(耳鼻咽喉科学)

资助基金：石河子大学自主资助支持校级科研项目ZZZC202136

在线出版日期：2023-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：193-197,203