基于生物信息学分析鉴定上皮性卵巢癌预后不良的关键基因

摘要：

目的:利用生物信息学方法探究上皮性卵巢癌发生发展的关键基因,寻找潜在的预后相关分子标志物,为探索上皮性卵巢癌潜在治疗靶标提供理论依据.方法:从NCBI-GEO数据库获得GSE36668和GSE114407测序数据,利用R软件分析基因芯片GSE36668和GSE114407并筛选差异基因.利用STRING数据库构建蛋白互作网络,采用Cytoscape软件中的4种拓扑法筛选出关键基因.利用GTEx数据库、TCGA数据库和人类蛋白质图谱数据库分别从转录层面与翻译层面对关键基因的表达水平进行验证.利用Kaplan-Meier绘图仪对关键基因进行生存预后分析.结果:从GSE36668和GSE114407芯片获得表达上调的基因有35个,下调的基因有26个.通过4种拓扑法获得了 8个关键基因分别为:CCNE1、CENPA、CENPF、MKI67、NCAPG、TOP2A、TPX2和TTK.通过多数据库、多层面的验证发现上述关键基因在上皮性卵巢癌患者样本中表达显著上调且与上皮性卵巢癌患者预后显著相关.结论:通过生物信息学分析获得8个关键基因,这些基因在上皮性卵巢癌的发生发展中发挥重要作用,为探究上皮性卵巢癌的预后不良机制和探索新的治疗靶点提供理论依据与新的方向.

关键词：上皮性卵巢癌、生物信息学、关键基因、预后标志物

所属期刊栏目：44

分类号：R737.31(肿瘤学)

在线出版日期：2023-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：499-502,511