基于生物信息学分析参与弓形虫感染巨噬细胞的关键基因

摘要：

目的:通过生信分析筛选弓形虫感染巨噬细胞过程中发挥潜在作用的基因,为弓形虫的防治提供更多的理论依据和研究方向.方法:从GEO数据库下载GSE29582基因芯片数据集,使用RStudio软件对弓形虫RH虫株感染前后差异表达基因进行分析.通过DAVID对差异表达基因进行基因本体论分析(GO)和基因富集分析(KEGG),利用Cytoscape 3.7软件构建蛋白与蛋白互作网络,并利用BINGO、ClueGO和CytoHubba插件进行关键基因和信号通路的预测与分析.结果:弓形虫感染宿主巨噬细胞后存在基因差异表达,以基因的下调为主,差异表达基因的功能主要富集在黏附分子的黏附作用、细胞因子与其受体、炎症反应和免疫调节等方面.通过RStudio软件、PPI网络及CytoHubba等插件进行综合分析发现,Il-1 β、Cxcl2、Arg1、Erg2、Erg3、Cdh1这6个基因在弓形虫感染的巨噬细胞中具有潜在作用,且其主要在细胞因子与趋化因子相关的通路发挥作用.结论:筛选出6个在弓形虫感染宿主巨噬细胞过程中的关键差异表达基因,弓形虫很可能主要通过这些基因调节免疫应答和炎症反应中细胞因子和趋化因子的作用,从而逃避免疫系统的清除.

关键词：弓形虫、巨噬细胞、免疫逃逸、炎症、感染

所属期刊栏目：44

分类号：R37(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：石河子大学SRP项目2020089

在线出版日期：2022-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：6-12,30