脊髓损伤分子机制的生物信息学分析

摘要：

目的:探讨创伤性脊髓损伤(spinal cord injury,SCI)的分子机制.方法:从GEO数据库下载SCI组和假手术组GSE45006基因芯片数据,通过GEO2R在线工具筛选差异表达基因(DEG).使用DAVID和Web-Gestalt数据库进行DEG的功能富集分析.从STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过软件Cytoscape及其MCODE插件模块分析,再利用DAVID数据库重新分析.结果:与假手术相比,在创伤后的1、3 d和1、2、8周分别鉴定出2155、885、1278、1006、1003个DEGs.在创伤后的1、3 d和1周,对其生物信息学分析发现,DEGs富集于炎症反应和免疫反应.通过PPI网络构建及模块分析发现20个中心节点,20个基因经DAVID数据库重新KEGG分析后发现CCNA2、Cdk1、Mcm2、Mcm4、Mcm6基因显著富集于细胞周期途径,可能在SCI发生发展中起到关键作用.结论:本研究提供了有关创伤性SCI分子机制的见解,可能有益于未来SCI研究并有助于治疗的发展.

关键词：脊髓损伤、生物信息学分析、基因芯片

所属期刊栏目：40

分类号：R651.2;Q811.4(外科学各论)

在线出版日期：2021-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：89-96