乙型肝炎病毒X基因区序列的系统发育树分析

摘要：

目的:研究利用乙型肝炎病毒X基因区序列构建系统发育树进行基因型分析的可靠性.方法:从美国NCBI基因库中下载HBV全基因序列共249条,其中166条为已知基因型的序列,83条为未知型序列.利用ClustalX 1.8软件和TreeView软件对已知基因型的X区序列构建进化树图,分析由该方法获得的基因型是否与原来的吻合,并对未知型序列进行基因型分析,再用S区的进化树分析加以验证.结果:已明确基因型的166条序列利用X基因区序列分析得到的基因型与原先的基因型完全吻合.用X区和S区序列分析方法对83条未知型序列分析的结果是一致的,分别获得A型16条、B型17条、C型27条、D型21条及F型2条,未发现E、G和H型.结论:利用乙型肝炎病毒X基因区序列进行基因型分析是完全可靠的,有助于HBV的致病机制研究.

关键词：乙型肝炎病毒、基因型、系统发育树、X基因

所属期刊栏目：24

分类号：R512.62;Q939.4(传染病)

资助基金：国家自然科学基金30471951

在线出版日期：2005-06-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：143-146