10.3969/j.issn.1001-4616.2011.01.019
植物内生细菌XG32菌株16S rRNA寡核苷酸探针杂交条件优化和特异性验证
为了能利用荧光原位杂交方法来研究植物内生细菌XG32菌株在植物体内的定殖和分布,利用XG32菌株的16S rRNA中段特异性序列和Genbank数据库,用BLAST、DNAclub和Oligo软件设计了一个在理论上具有特异性的探针,在优化该探针的杂交条件基础上,通过与12个亲缘关系相邻和相近的菌株反复杂交来验证探针的特异性.结果显示,XG32探针适宜的杂交条件为:杂交缓冲液中甲酰胺浓度为35%,NaCl浓度为1.2 mol/L,杂交温度为42℃,清洗缓冲液中NaCl浓度为0.02 moL/L;探针与XG32菌株杂交信号明显,与其他菌株均不能杂交.综上所述,设计的探针是XG32菌株的特异性探针.
荧光原位杂交、杂交条件优化、特异探针验证
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Q938.1(微生物学)
江苏省高校自然科学基础研究项目07KJB180063
2011-08-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
89-95