基于纤毛鹅观草特异的卫星重复序列开发寡核苷酸探针

摘要：

[目的]本文旨在开发纤毛鹅观草特异的寡核苷酸(oligonucleotide,oligo)探针,进一步完善纤毛鹅观草染色体鉴定技术.[方法]利用前期选育的普通小麦-纤毛鹅观草异附加系DA2Sc L和DA6Sc,通过流式分拣和基因组二代测序获得纤毛鹅观草染色体6Sc和染色体臂2Sc长臂的基因组序列,利用Repeatexplorer2/TAREAN软件从中鉴定出卫星重复序列并设计成oligo探针,通过荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)分析所开发oligo探针的应用价值.[结果]从6Sc和2Sc L基因组序列中共鉴定出11个卫星重复序列并开发成11个oligo探针,oligo-FISH结果表明,其中6个探针可以在纤毛鹅观草染色体上产生明显杂交信号,而在小麦染色体上未产生明显杂交信号,可用于特异鉴定小麦背景中的纤毛鹅观草染色体或片段.对1套普通小麦-纤毛鹅观草异附加系oligo-FISH分析发现,oligo-2Sc L-163和oligo-6Sc-111仅在Sc基因组染色体上产生明显信号,可作为纤毛鹅观草Sc组特异探针;将oligo-2Sc L-161和oligo-2Sc L-163组合,对1整套二体异附加系进行双色oligo-FISH,构建了纤毛鹅观草染色体的oligo-FISH核型.[结论]本研究提供了纤毛鹅观草重复序列组成的初步信息,开发的探针能特异鉴定纤毛鹅观草染色体,阐明纤毛鹅观草2个基因组的来源和分化,对推动纤毛鹅观草优异基因的转移和利用有重要意义.

关键词：纤毛鹅观草、普通小麦-纤毛鹅观草异附加系、染色体分拣、卫星重复序列、寡聚核苷酸探针、荧光原位杂交

所属期刊栏目：45

分类号：S512(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;江苏省现代农业产业技术体系JATS2020411

在线出版日期：2022-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：442-452