ADT基因家族的鉴定及PbADT1在梨果实中的功能分析

摘要：

[目的]本文旨在对前酪氨酸脱水酶(ADT)基因家族进行鉴定,分析其进化过程、基因结构、保守功能域、共线性关系和表达特性,并对梨ADT在石细胞形成过程中的功能进行初步验证.[方法]基于已公布的20个物种全基因组数据,采用BLASTp和Hmmer结合的方法进行成员鉴定,通过多种生物信息学手段分析序列.利用转录组数据和RT-qPCR检测梨ADT成员在果实发育中各个阶段的表达模式.利用农杆菌介导的瞬时转化法在梨幼果中过量表达PbADT1基因,通过间苯三酚染色观察幼果石细胞团分布,并测定木质素含量及其通路基因的表达量.[结果]在20个物种中共鉴定了113个ADT家族成员.通过系统进化树将家族成员分为4个亚组,6个水生藻类中都仅有1个ADT基因被鉴定,随后进化出的陆生植物中ADT基因家族均得到了不同程度的扩张.梨果实发育的转录组数据表明,多个ADT基因的高水平表达集中在花后35 d,RT-qPCR的结果证实了这一点.PbADT1的瞬时过量表达使梨幼果石细胞和木质素含量增加,并提高了木质素关键合成酶的表达水平.[结论]ADT基因在植物从水生向陆生进化的过程中得到了大量扩张,其蛋白水解酶生成的苯丙氨酸是合成木质素和形成维管束的底物基础.梨石细胞在幼果发育期大量形成,ADT在梨中的表达模式表明该基因家族可能调控果实石细胞的形成,PbADT1在梨果实中的瞬时过量表达使木质素含量升高、石细胞扩散加剧,表明ADT基因的过表达可能通过提高关键合成酶的表达水平对梨石细胞的形成产生影响.

关键词：前酪氨酸脱水酶(ADT);木质素;物种进化;梨;生物信息学;功能验证

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分类号：S661.2(果树园艺)

资助基金：国家重点研发计划项目;国家自然科学基金项目;江苏省农业科技自主创新资金[CX183029;江苏现代农业梨产业技术体系高效栽培创新团队;兵团南疆重点产业发展支撑计划项目

在线出版日期：2021-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：656-666