侵染安徽玉米的水稻黑条矮缩病毒全基因组特征

摘要：

[目的]测定水稻黑条矮缩病毒(Rice black-streaked dwarfvirus,RBSDV)安徽分离物全基因组序列,分析RBSDV安徽分离物与RBSDV其他分离物以及斐济病毒属(Fijivirus)其他成员之间的分子差异,为明确RBSDV遗传变异与进化规律提供重要信息.[方法]采用RT-PCR法从安徽玉米粗缩病样本中扩增RBSDV的全基因组,克隆、测序并进行序列分析.[结果]获得RBSDV安徽分离物全基因组序列.序列比对发现,RBSDV安徽分离物与其他RBSDV各个分离物S1到S10的序列相似性较高,为87.6％ ～ 99.5％,其中与RBSDV韩国分离物(RBSDV-KOR)序列相似性最高,达94.6％ ～ 99.5％;从构建的系统关系树也可以看出,RBSDV安徽分离物和其他所有RBSDV分离物均聚成一个单独的分支.[结论]RBSDV各分离物之间亲缘关系很近.RBSDV安徽分离物与RBSDV-KOR亲缘关系最近,可能起源于相同的祖先.另外,推测RBSDV各个基因组片段可能是协同进化的.

关键词：水稻黑条矮缩病毒、安徽分离物、全基因组、序列分析

所属期刊栏目：38

分类号：S435.111.4(病虫害及其防治)

资助基金：国家自然科学基金项目31371915;安徽省教育厅自然科学基金重点项目KJ2012A113

在线出版日期：2015-12-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：943-949