基于线粒体COI基因序列分析家鸭系统发育关系
根据北京鸭线粒体DNA( mtDNA)序列设计引物,对中国9个地方鸭和1个番鸭品种线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(CO Ⅰ)基因序列进行PCR反应和测序,并从起始密码子开始分析了1 520 bp的序列.结果显示:所有家鸭个体在1 517位点出现1个T碱基缺失,番鸭与家鸭的mtDNA COI基因碱基组成相似；9个鸭品种个体共检出11种单倍型,单倍型的多样度为0.856.聚类分析结果显示,所有家鸭品种间的遗传距离为0.001～0.002,种内平均值为0.001；番鸭与家鸭遗传距离为0.003 ～0.006.基于Kimura-2模型构建的系统发育进化树进行分析,发现所测定的鸭科物种个体大体分为3类:家鸭与栖鸭属的番鸭聚为第1类,应属于鸭亚科；雁属的白额雁、灰雁与天鹅属的黑天鹅聚为第2类,应属于雁亚科；鹊雁与中国骛一起聚为第3类,应属于鹊雁亚科.上述结果表明,基于COⅠ基因条形码,在亚科阶元上,所有鸭科物种分类与以往分类结果是一致的.因此,使用DNA条形码鉴定物种系统发育关系时,需考虑阶元划分标准.
鸭、细胞色素氧化酶Ⅰ、DNA条形码、线粒体
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S813.9;S834(普通畜牧学)
江苏省自然科学基金项目SBK201021501;教育部高校博士点新教师基金项目200803071048;南京农业大学青年科技创新基金项目KJ09013;江苏省农业科技自主创新资金项目cx09 116
2012-03-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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109-114
