苹果Ty1-copia类逆转座子LTR10序列及其在苹果属植物中的遗传多样性分析
应用改良的Pearce方法分离苹果Tyl-copia类逆转座子RNaseH-LTRs,分离到的RNaseH-LTR10序列已在GenBank注册(登录号DQ534515),该序列长度为299 bp.分析结果表明其5'端为含有终止密码子的RNaseH基因,PPT(polypurine tract)之后是3'-LTR,PPT起始于终止密码子内10 bp处,3'-LTR的起始标志末端倒转重复序列(inverted repeat,IR)TG紧随其后.LTR10的正链和反链均含有多个启动子的特征结构TATA box和CAAT box,α-淀粉酶启动子的保守序列及受不同胁迫条件作用的调控元件,如AuxRE、ABRE、HSE等.利用S-SAP技术研究了LTR10逆转座子在苹果属8个野生种和22个栽培品种中的遗传多样性,多态性片段比例为86.5%;品种长祝较祝光少1条约400 bp的特异性扩增条带.
苹果、Ty1-copia类逆转座子LTRs、调控元件、遗传多样性
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S661.1(果树园艺)
国家自然科学基金项目30200190,30740034;安徽农业大学稳定与引进人才科研启动专项基金项目wd2006-8
2011-01-28(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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