茶树紫黄素脱环氧化酶基因的cDNA克隆及其生物信息学分析

摘要：

根据GenBank中已登录的植物紫黄素脱环氧化酶(VDE)基因序列,以其高度保守的氨基酸序列设计一对简并引物,采用RT-PCR与3′/5′-RACE相结合的方法, 从茶树(Camellia sinensi)中克隆出VDE的全长cDNA,长度为1 632 bp.分析表明,该序列的5′-端和3′-端的非编码序列长度分别为61 bp和140 bp,开放阅读框为1 422 bp,编码473个氨基酸,其转运肽长度为132个氨基酸.成熟蛋白的氨基酸序列与拟南芥、莴苣、菠菜及烟草的同源性分别为83.5%,82.7%,82.1%和83.6%,且有3个特殊的结构域:半胱氨酸富集区、脂肪结合蛋白特征区和由谷氨酸富集的高电荷区.分析表明,茶树VDE具有热稳定性.

关键词：茶树、紫黄素脱环氧化酶、cDNA、生物信息学、叶黄素循环

所属期刊栏目：26

分类号：S571.1;Q781

资助基金：农业部农业结构调整技术研究专项基金2002-12-02A;安徽省教育厅自然科学基金2000JL067

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：14-19