碧桃花瓣转录组微卫星特征分析

摘要：

为开发碧桃转录组微卫星信息，利用454高通量测序技术，对其花瓣转录组序列进行SSR位点发掘，结果发现含SSR的序列4705条，共得到5668个SSR，平均每3．49 kb出现1个SSR。微卫星序列主要以三碱基重复为主，约占总数的42．66％。笔者共发现516种碱基重复基元，所占比例最高的为（AG／CT）n（18?34％），其次是（ AAG／CTT） n（12?42％）。微卫星多为重复长度小于20 bp 的短序列，长度大于20 bp 的微卫星仅占总数的12?13％。研究还发现碧桃花瓣微卫星的频率和长度呈显著负相关（ P＜0?05），相关系数为－0?246。

关键词：碧桃、微卫星、SSR、转录组、高通量测序

分类号：Q948;Q78(植物学)

资助基金：林业公益性行业科研专项重大项目;国家自然科学基金;江苏高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2015-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：34-38