松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90基因结构特征及其分子进化

摘要：

转录组的多态性是探讨物种多样性与分子进化的重要方面.笔者选取物种间保守性较高的HSP70、HSP90蛋白作为研究对象,探讨二者在松材线虫和拟松材线虫基因组中的结构差异,探明他们在松材线虫和拟松材线虫中的特点,并试图揭示两种线虫的系统发育关系.结果表明二者内含子具有丰富的多态性,内含子中的G+C含量也显著不同.核酸序列gABG和gmc2分别编码松材线虫和拟松材线虫HSP70的642个氨基酸,相似性高达99％,仅存在9个氨基酸的差异,并且这种差异是由13个碱基的多态性造成的.gSBO和gmc19分别编码松材线虫和拟松材线虫的HSP90,其氨基酸序列相似性为92％.对同义密码子的偏好性分析表明,17种氨基酸对应的58个密码子中,gSBG和gmc2存在10个密码子差异,gABO和gmc19存在5个密码子差异.采用邻接法分别构建的系统进化树表明松材线虫与拟松材线虫hsp70和hsp90在系统发育关系上最为接近,并与其他线性动物门物种高度同源.

关键词：松材线虫、拟松材线虫、多态性、同义密码子、分子进化

所属期刊栏目：39

分类号：S763;Q781(森林保护学)

资助基金：国家科技支撑计划;江苏高校优势学科建设工程项目

在线出版日期：2015-03-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：11-16