杨树部分基因起始密码子AUG侧翼序列特征分析

摘要：

对297条杨树基因序列的起始密码子AUG侧翼区序列(-20位点-+6位点)的碱基分布特性进行了统计学分析,并对高表达基因和低表达基因翻译起始位点侧翼序列碱基的保守性和关联性进行了对比分析.结果表明:紧邻起始密码子5'端的-1、-2、-3、-4、-5和-6位点均强烈偏好A,+4位点强烈偏好G,同时高表达和低表达基因的-20位到+4位中某些位点的保守性存在较大差异,其中高表达基因的-6,-3和+4位可能与其高表达的特性有关;通过关联性分析可以看出,在起始密码子侧翼序列的某些特定区域碱基之间的关联性可能也与翻译起始效率有关系;相关性分析表明低表达基因的ACGCAI主要受到"AUG侧翼区"序列的GC含量的影响,低表达基因在AUG侧翼区富集GC对翻译有一定影响.

关键词：杨树、AUG侧翼序列、保守性、关联性、ACGCAI值

所属期刊栏目：32

分类号：Q811(生物工程学(生物技术))

资助基金：江苏省自然科学基金资助项目BK2003213

在线出版日期：2009-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：61-64