基于荧光定量PC R和高通量测序技术的葡萄园土壤细菌群落结构多样性分析
土壤细菌在葡萄园生态系统中起着重要作用，具有十分重要的生态功能。以贵州镇远葡萄园基地根际、非根际土壤为研究对象，在对土壤的基本理化指标及酶活检测的基础上，采用荧光定量PCR（Q-PCR）和Illumina Miseq高通量测序技术对葡萄园根际和非根际土壤的细菌菌群结构进行分析。结果表明，葡萄园根际土壤细菌16S rRNA基因的拷贝数在1.38×108～1.17×109 copies/g之间，高于非根际土壤。Illumina Miseq高通量测序显示，葡萄园根际土壤细菌呈多样性分布且优势菌群突出，主要涵盖了变形菌门（Protecbacteria），放线菌门（Actinbacteria），酸杆菌门（Acidobacteri），厚壁菌门（Firmicute），绿弯菌门（Chloroflexi），蓝藻门（Cyanobacteria），泉古菌门（Crenar-choeo），拟杆菌门（Bacteroidetes），芽单胞菌门（Gemmatimonadete），硝化螺旋菌门（Nitrospirae）。其中变形菌门和放线菌门为优势菌群，两者相对丰度之和占到了53.33%～67.28%。葡萄园根际土壤的主要优势细菌属包括乳球菌属（Lactococcus），节细菌属（Arthrobacter），Candidatus nitrososphaera，亚硝化螺菌属（Nitrososphaera），热单胞菌属（Thermomonas），Phycicoccus，泛菌属（Pantoea），芽孢杆菌属（Bacillus），埃希氏杆菌属（Escherichia），鞘脂单胞菌属（Sphingomonas），和溶杆菌属（Lysobacter）。α多样性分析表明，不同位点的根际土壤细菌多样性比较接近，而根际土壤细菌多样性低于非根际土壤。冗余分析（RDA）进一步分析表明，葡萄园土壤细菌群落多样性与土壤养分及酶活存在不同程度的相关关系，群落结构多样性受多种因素的影响。
葡萄园土壤、根际土壤、细菌多样性、高通量测序、荧光定量PCR
TS262.6;Q93-3;TS261.1;TS261.2(食品工业)
华南理工大学“学生研究计划”SRP项目105612015S533。
2016-12-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
28-33,36
