基于生物信息学的葡萄膜黑色素瘤缺氧相关lncRNA预后模型的构建

摘要：

目的 基于生物信息学构建葡萄膜黑色素瘤(UM)缺氧相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后模型.方法 从TCGA数据库中筛选UM lncRNA表达谱及临床信息数据.采用Lasso回归、单因素与多因素Cox回归鉴定UM缺氧相关ln-cRNA 预后标志物并构建预后模型;ROC评估预后模型灵敏度和特异度并绘制列线图.根据中位风险评分将UM分为高风险组和低风险组;采用Kaplan-Meier比较高、低风险组患者总生存期.采用KEGG对基于缺氧相关lncRNA差异基因进行功能富集分析.结果 共获得983个缺氧相关的lncRNA.共筛选出7个具有独立预后意义的UM缺氧相关lncRNA预后标志物(AC100791.3、SOS1-IT1、LHFPL3-AS1、AP005121.1、AL121820.2、LINC01006、AC104825.1)并构建其预后模型.预后模型的风险评分是UM患者的独立预后因素(P＜0.001).ROC结果显示,预后模型具有较高的准确性.高风险组总生存期低于低风险组(P＜0.001).KEGG富集分析结果显示,氧化磷酸化通路、乙醛酸与二羧酸代谢、系统性红斑狼疮、抗原的加工与呈递、P53信号通路富集于高风险组人群.结论 基于7个缺氧相关lncRNA构建的预后模型可预测UM患者的预后价值.

关键词：葡萄膜黑色素瘤、缺氧、lncRNA、预后模型

所属期刊栏目：52

分类号：R739.7(肿瘤学)

资助基金：贵阳市科技计划项目

在线出版日期：2024-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：554-558