基于SNP标记的青海湖裸鲤遗传多样性及种群结构研究

摘要：

为探究青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii)的种质资源现状,为该物种保护措施的制定提供参考依据.首次利用基因分型技术(Genotyping-by-sequencing,GBS),对青海湖水域的6个地理群体共72尾青海湖裸鲤进行单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)标记开发和遗传特征分析.共检测出1 600 061个SNP位点,质控后筛选出45 266个高质量的SNP位点用于遗传分析,发现核苷酸多样性(Pi)为0.317 0～0.327 4,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.459 4～0.482 3和0.336 7～0.3444.6个地理群体的遗传距离(D)为0.018 4～0.023 3,两两群体的遗传分化系数(Fst)均不显著(P＞0.05).分子方差分析(Analysis of molecular variances,AMOVA)显示102.37％的遗传变异来自群体内;群体遗传结构和系统发育进化树分析均显示6个群体属于一个集群,具有遗传同质性;而主成分判别分析(Discriminant analysis of principal components,DAPC)表明哈尔盖河、黑马河和沙柳河群体相互交叉聚类,其余3个地理群体分别聚类.综上,6个青海湖裸鲤群体的Ho均大于He,种群结构单一.

关键词：青海湖裸鲤、单核苷酸多态性、基因分型技术、遗传分化、渔业资源

所属期刊栏目：19

分类号：S932(水产资源)

资助基金：国家重点研发计划;西北地区重点水域渔业资源与环境调查专项;中国水产科学研究院基本科研业务费专项

在线出版日期：2023-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：86-96