基于坏死性凋亡相关基因的生物信息学分析构建喉癌复发风险预测模型

摘要：

目的 构建基于坏死性凋亡相关基因的喉癌复发风险预测模型.方法 获取癌症基因组图谱数据库的111例喉癌样本数据作为训练集,获取基因表达综合数据库(GEO)GSE27020集109例喉癌样本作为验证集.使用R软件进行数据分析和处理,筛选出喉癌组织与正常组织之间差异表达的坏死性凋亡基因,用LASSO回归分析进行关键基因筛选并构建喉癌复发风险预测模型.运用ROC曲线和Kaplan-Meier生存分析评价该模型.采用多因素Cox回归鉴定该模型是否可作为喉癌复发的独立预测因子.结果 成功构建由6个坏死性凋亡相关基因组成的喉癌复发风险预测模型.Kaplan-Meier生存分析结果显示低风险组复发风险较低(P＜0.01).ROC曲线显示1年、3年和5年无复发生存率的AUC值分别为0.767、0.827和0.765.多因素Cox回归分析显示该模型可作为独立的复发预测因子(HR=3.235,95％CI 1.777～5.888,P＜0.01).在GEO验证集中同样验证了该模型的有效性.结论 成功构建一个基于6个坏死性凋亡相关基因的喉癌复发风险预测模型,为患者的复发预测及个体化治疗提供帮助.

关键词：喉癌、坏死性凋亡基因、复发风险预测模型、生物信息学

所属期刊栏目：34

分类号：R739.6(肿瘤学)

资助基金：浙江省自然科学基金;宁波大学校级重点教研项目;浙江省卫生健康科技计划;宁波市自然科学基金

在线出版日期：2022-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：445-447,封3