10.3969/j.issn.1671-0800.2022.03.004
核受体结合SET域蛋白1催化活性区域B细胞优势表位的预测与分析
目的 预测核受体结合SET域蛋白1催化活性区域(NSD1-CD)B细胞优势表位,并分析其功能.方法 以NSD1-CD的氨基酸序列为基础,利用生物信息学软件,采用Hopp&Woods亲水性方案、Zimmerman极性参数、Jameson-Wolf抗原指数方案和Emini表面可及性方案等,进一步运用抗原指数预测,并结合三级结构分析NSD1-CDB细胞优势表位及其功能.结果 NSD1全长为2696个氨基酸,NSD1-CD(1 852~2082)由231个氨基酸组成,相对分子质量为26.53 kDa.经综合分析,NSD1-CDB细胞优势表位可能存在于NSD1全长序列N端的1 865~1 869及1 959~1964区段,优势表位KKPPP(1 865~1 869)距离s-腺苷甲硫氨酸较近,可能与转甲基功能关系紧密.结论 多参数预测NSD1-CD B细胞优势表位可为应用多肽小片段制备单克隆抗体、表位疫苗及研究其蛋白功能提供重要的依据.
组蛋白赖氨酸甲基化酶、核受体结合SET域蛋白1、B细胞表位
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R730.51(肿瘤学)
2022-05-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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