急性心肌梗死患者循环内皮细胞相关基因的生物信息学分析

摘要：

目的 应用生物信息学法对急性心肌梗死(AMI)患者外周血循环内皮细胞的相关基因进行分析.方法 从基因表达综合数据库(GEO)中下载基因芯片数据集GSE66360,利用GEO2R、DAVID及STRING等分析平台筛选差异表达基因,并进行基因本体(GO)分析、信号通路(KEGG)分析及蛋白一蛋白相互作用网络(PPI)分析,应用Cytoscape软件进行模块分析并筛选核心基因.结果 共筛选出2个下调基因和80个上调基因,差异表达基因主要富集于免疫应答、炎症反应、碳水化合物类结合、细胞外基质、细胞因子-细胞因子受体相互作用等生物学过程;识别出的9个核心基因中,IL1B、SLC11A1及LILRB2为显著上调的差异基因,CCR2为下调基因.结论 AMI时循环内皮细胞出现表达变化的基因功能主要富集在免疫应答、炎症反应、碳水化合物类结合、细胞外基质、细胞因子-细胞因子受体相互作用等生物学过程,其中显著变化的核心基因IL1B、SLC11A1、LILRB2及CCR2可能发挥着重要作用,可能是AMI的预防和治疗的靶点.

关键词：动脉粥样硬化、微阵列分析技术、内皮细胞、心肌梗塞、计算生物学

所属期刊栏目：32

分类号：R542.2+2(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：宁波市自然基金项目2017A610209

在线出版日期：2020-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：154-155,200,封3