远端上游元件结合蛋白1调节肝癌细胞中长链非编码RNA表达的实验研究

摘要：

目的 筛选肝癌细胞中受远端上游元件结合蛋白1 (FUBPl)调节的长链非编码RNA(lncRNAs).方法 通过慢病毒介导不同肝癌细胞株中(MHCC97H、MHCC97L和Huh7)过表达FUBP1,利用定量PCR的方法鉴定过表达效率.利用芯片的方法筛选过表达FUBP1后肝癌细胞株中差异表达的lncRNAs,并利用定量PCR验证结果.利用生物信息学的方法确定差异表达的lncRNAs与mRNAs的共表达网络.结果 以对照组中FUBP1的表达量为1,慢病毒感染的MHCC97H、MHCC97L和Huh7肝癌细胞株中FUBP1的mRNA水平分别为3.28±-0.15、2.75±-0.26和4.25士0.35,明显高于对照组(均P＜0.01).芯片结果显示,共有12个lncRNA在3种细胞株中具有一致的表达变化,包括3个上调和9个下调.定量PCR验证结果与芯片结果一致,其中lnc-ARF6-3下调最明显,lnc-BCAS2-1上调最明显.lnc-BCAS2-1、lnc-USP9X-3、lnc-LYZ-2和lnc-C 14orf135-3与FUBP1具有共表达网络.结论 FUBP1诱导肝癌细胞中lncRNAs的表达紊乱,FUBP1-lncRNAs的表达网络可能与肝癌的发展和转移密切相关.

关键词：远端上游元件结合蛋白1、长链非编码RNA、原发性肝细胞癌、共表达网络

所属期刊栏目：30

分类号：R73-3;R735.7(肿瘤学)

资助基金：浙江省自然科学基金LY16H16004;宁波市自然科学基金2015A610025;中国肝炎防治基金会天晴肝病研究基金TQGB20150108

在线出版日期：2018-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：713-715,807,封3