基于氨基酸结构信息的MHCⅠ类抗原表位的定量构效关系建模

摘要：

目的 主要组织相容复合物(MHC)在细胞免疫中具有重要作用,MHC与表位亲和力的大小直接影响T细胞免疫响应的强弱,因此准确预测MHC-表位的结合亲和力可以提高表位的筛选效率并且降低实验成本.方法 筛选89种天然氨基酸的理化性质用于15个MHCⅠ类分子亚型表位的结构表征,然后使用逐步线性回归(STR)方法优选对亲和力具有重要贡献结构参数建立预测模型,最终用多元线形回归法(MLR)方法建立了15个MHC亚型的QSAR模型.结果 建立的QSAR模型具有稳定性高、预测能力强等优点,能确定表位中各氨基酸及其相应理化性质队对亲和力的贡献,并可很好解释MHC与表位的相互作用机理.结论 STR-MLR建模方法具有计算简便、易于解释、性能优异、物化意义明确等优势.

关键词：表位、主要相容性复合物、定量构效关系

所属期刊栏目：27

分类号：R392.9

资助基金：国家自然科学基金;重庆市教委科学技术研究项目;重庆市科委自然科学研究项目

在线出版日期：2012-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：829-832