癌胚抗原低亲和力表位改造中的分子对接

摘要：

目的通过分子对接方法筛选表位改造后的高亲和力CTL表位.方法在图形工作站上,将癌胚抗原来源的低亲和力表位及其N末端第一位残基以酪氨酸替换后的突变体,分别与MHC Ⅰ类分子进行对接,对接所得最佳构象进行600 ps分子动力学模拟修正.结果改造后的突变体与MHC分子间存在较强的氢键和疏水相互作用,组成肽结合槽口袋A的基Tyr7、Tyr171和Tyr159与多肽N末端形成稳定的氢键作用网络,并且P1位酪氨酸上的苯环可与Trp167上的苯环发生π-π堆积作用.结论分子对接模型预测的肽-MHC复合物作用模式,提示改造后的突变体与MHC Ⅰ类分子间具有更高的亲和力,与实验结果一致.

关键词：MHCⅠ类分子、CTL、表位、分子对接、分子动力学

所属期刊栏目：21

分类号：R392.11

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划2001CB510001;中国科学院资助项目90208028,30490240

在线出版日期：2005-12-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：514-517