SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测

摘要：

目的预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构.方法以SARS病毒基因组序列为基础,采用Gar-nier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schultz方法预测E蛋白质的二级结构;用Kyte-Doolittle方案预测蛋白质的亲水性;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性;用Jmeson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数.综合评判,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位.结果在SARS病毒E蛋白N-端的第1～6、13～19、39～43、47～64区段和第73～76区段有β-折叠中心;第6～12区段和第67～69区段可能形成转角或无规则卷曲,是柔性区域.E蛋白N端第2～13区段和第61～74区段为B细胞优势表位区域.结论用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位,为实验方法探索SARS冠状病毒E蛋白的B细胞表位提供理论依据.

关键词：SARS病毒、E蛋白、B细胞表位、二级结构、预测

所属期刊栏目：19

分类号：R392.11

在线出版日期：2004-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：407-410