基于多标签传播机制的蛋白质相互作用网络功能模块检测

摘要：

鉴于多标签传播算法在发现社会网络的社区结构研究上具有快速、高效的求解能力,提出融合多源蛋白质生物学知识的基于多标签传播机制的蛋白质相互作用(PPI)网络功能模块检测算法.首先,结合PPI网络功能信息和结构信息初始化节点的标签.然后,利用基因表达数据描述蛋白质间的共表达性,依据共表达性构建标签集合,从中选择标签以实现标签在节点间真实可靠的传播.最后,将具有相同标识符的节点划分到同一功能模块中,获得最终结果.实验表明文中算法不仅具有良好的时间性能,而且在检测精度上也具有一定的竞争性.

关键词：蛋白质相互作用(PPI)网络、功能模块检测、多标签传播、生物学知识

所属期刊栏目：29

分类号：Q811.4;Q51(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金项目61375059,61332016;教育部博士点学科专项科研博导类基金项目20121103110031;北京市教委科研计划重点项目No.KZ201410005004资助 Supported by National Natural Science Foundation of China61375059,61332016;Specialized Research Fund for the Doctoral Program of Higher Education20121103110031;the Beijing Municipal Education Research Plan Key ProjectKZ201410005004

在线出版日期：2016-08-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：548-557