春小麦主要籽粒性状的全基因组关联分析

摘要：

为挖掘控制春小麦主要籽粒性状的关联SNP及候选基因,以国外引进品种、新疆地方品种、新疆自育品种共298份春小麦品种为材料,利用小麦55K SNP芯片,对5个环境下小麦千粒重、粒长、粒宽3个主要籽粒性状进行基于Q+K混合线性模型(mixed linear model,MLM)的全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).结果表明,供试小麦品种的3个主要籽粒性状在5个环境下的变异系数为3.89％～19.77％,其中粒宽的变异幅度最小,千粒重的变异幅度最大.不同环境中,新疆育成品种的3个主要籽粒性状的平均值均最高,而新疆地方品种的3个籽粒性状的平均值均最低.GWAS结果表明,共检测到84个与小麦主要籽粒性状显著关联的稳定SNP位点,它们分布在小麦的21条染色体上,单个SNP位点可解释3.74％～11.18％的表型变异.在1B、2B、3B、4B、5A、5D染色体上检测到6个同时关联多个籽粒性状的稳定位点.对84个SNP位点进行候选基因筛选,筛选到6个可能与小麦主要籽粒性状相关的候选基因,可作为小麦籽粒研究的重要基因.

关键词：小麦、籽粒性状、全基因组关联分析、SNP、候选基因

所属期刊栏目：42

分类号：S512.1;S330(禾谷类作物)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;乌鲁木齐市科学技术计划项目;新疆维吾尔自治区农牧业骨干人才培养项目

在线出版日期：2023-01-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1182-1191