陆地棉AGPase基因家族的鉴定及表达分析
[目的]腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(adenosine diphosphate-glucose pyrophosphorylase,AGPase)是淀粉生物合成途径的限速酶,在植物"源"、"库"器官淀粉的合成与积累过程中扮演着重要角色,然而棉花中AGPase基因家族的系统研究工作尚未开展.[方法]基于已公布的陆地棉标准系TM-1基因组数据,利用生物信息学方法对陆地棉AGPase基因家族进行全基因组鉴定,并对该家族成员的理化性质、系统进化关系、基因结构、启动子区顺式作用元件进行分析.利用转录组数据和实时荧光定量聚合酶链式反应分析AGPase家族基因的组织表达特性和在非生物胁迫下的表达模式.[结果]在陆地棉基因组中,共鉴定到20个AGPase基因(GhAGP),不均匀地分布在16条染色体上.GhAGP基因包含12个大亚基基因和8个小亚基基因共2类,同一类GhAGP基因具有相似的保守基序和外显子-内含子结构.GhAGP基因启动子区含有多个与植物激素、非生物胁迫响应相关的顺式作用元件.组织表达分析结果显示,GhAGP基因具有不同的组织表达模式.非生物胁迫下的表达分析表明,多数GhAGP基因响应低温、高温、盐和干旱胁迫诱导表达,其中GhAGPL1和GhAGPL7参与棉花对多种逆境胁迫的响应.[结论]明确了陆地棉AGPase基因家族成员的分布特征、结构特征以及系统进化特征,初步揭示了该家族基因在棉花响应外界环境胁迫中的功能,可为棉花淀粉性状的遗传改良和抗逆育种提供重要的候选基因资源.
腺苷二磷酸葡萄糖焦磷酸化酶(AGPase)、基因家族、非生物胁迫、表达模式、陆地棉
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S532;Q93-331;Q786
国家自然科学基金;河南省科技攻关计划;河南省高等学校青年骨干教师培养计划;河南省博士后科学基金项目
2022-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
299-312
