大丽轮枝菌侵染陆地棉早期的转录组分析

摘要：

[目的]旨在深入挖掘大丽轮枝菌致病相关基因.[方法]运用转录组测序技术比较分析了强致病力大丽轮枝菌Vd991在侵染陆地棉品种Coker 312早期阶段的基因表达情况.[结果]对Vd991侵染前后的转录组数据进行差异表达分析,共筛选到979个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),其中376个上调,603个下调.通过基因注释和功能分类发现,这些DEGs涉及细胞增殖与生长、产孢、碳水化合物结合、蛋白激酶活性调节、裂解酶活性、水解酶活性等功能.对上调DEGs进行基因本体(Gene ontology,GO)功能富集分析,发现共有277个GO词条达到显著富集水平(P＜0.05),涉及生长速率正向调控、核苷酸合成、解旋酶活性等功能;京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析表明,上调DEGs参与53个代谢通路,包括嘧啶代谢、嘌呤代谢等.[结论]在早期侵染过程中,大丽轮枝菌细胞增殖相关基因表现活跃.上述分析为进一步揭示大丽轮枝菌的致病机理提供了有价值的参考.

关键词：大丽轮枝菌、转录组分析、细胞增殖、致病机理

所属期刊栏目：29

分类号：S562.035(经济作物)

资助基金：国家科技重大专项——转基因生物新品种培育2016ZX08005003-003

在线出版日期：2017-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：253-260