10.11963/1002-7807.cpyzj.20170322
陆地棉KFB基因家族全基因组鉴定与表达分析
[目的]KFB (Kelch containing F-box protein)是普遍存在于各种生物体中含有F-box结构域的一类家族蛋白,参与众多生物过程.本研究旨在开展陆地棉KFB家族基因鉴定和表达分析.[方法]利用生物信息学方法从陆地棉(TM-1)基因组中鉴定KFB家族成员,与已知的拟南芥、水稻、大豆等KFB蛋白序列构建系统进化树;进一步针对第Ⅱ亚族进行基因结构、染色体定位和表达分析.[结果]从陆地棉基因组共鉴定出150个KFB家族成员,进化分析表明这些基因可分为7个亚族.陆地棉KFB第Ⅱ亚族24个基因分布在14条染色体上,有9对直系同源基因;该亚族基因结构简单,半数基因只有1个外显子;qRT-PCR结果表明,该亚族基因具有较为广泛的组织表达模式,但在不同组织的表达存在差异.[结论]这些结果显示陆地棉KFB第Ⅱ亚族基因在进化过程中出现了功能分化.
陆地棉、KFB基因家族、生物信息学、基因表达
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S562.03(经济作物)
国家科技重大专项2014ZX0800501B-003;国家自然科学基金U1403284;山东自然科学基金ZR2014CQ047;泰山学者建设工程专项ts201511070
2017-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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